Berdasarkan pemetaan yang dilakukan oleh PT KAI Daop 3 Cirebon, ada 12 titik daerah pemantauan khusus. Oleh karena itu, di titik-titik tersebut telah dilakukan pengawasan dan pemanatauan. Daerah-daerah pemantauan khusus tersebar disejumlah titik diantaranya,
LIma Titik lokasi potensi banjir seperti di BH 1085 KM 220 +700 s.d KM 220+800 antara Stasiun Cirebon Prujakan-Waruduwur, BH 915 KM 187+600 s.d 187+700 antara Stasiun Babakan-Losari.
KM 161+600 s.d 161+700 antara Stasiun Tanjung-Brebes, BH 941 KM 264+700 s.d 264+800 antara Stasiun Ciledug-Ketanggungan, BH 883 KM 252+500 s.d KM 252+800 antara Stasiun Ciledug-Ketanggungan.
Tujuh Titik daerah Lokasi kontur tanah labil seperti KM 148+700 s.d 151+700 Jalur Hulu antara Stasiun Cilegeh-Kedokangabus, KM 148+600 s.d 150+900 Jalur Hilir antara Stasiun Cilegeh-Kedokangabus.
